Documento del Centro Europeo de Másteres y Posgrados sobre el control de la expresión genética en procariotas. El Pdf, un material didáctico de Biología para Universidad, explora los operones Lac y Trp, sus componentes y mecanismos de regulación, incluyendo el control negativo y positivo, y la atenuación.
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C CENTRO EUROPEO DE MÁSTERES Y POSGRADOS- Índice
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Comprender los mecanismos de control de la expresión génica en células procariotas. Conocer el operón lac Entender el operón Trp
El control de la expresión génica en procariotas tiene lugar a nivel trans- cripcional. La regulación de la expresión de los genes adaptativos se puede realizar mediante dos mecanismos: inducción y represión.
Las bacterias, a pesar de ser organismos unicelulares, tienen que adaptar la expresión de sus genes a las condiciones ambientales. La regulación de dicha expresión puede realizarse a nivel transcripcional y/o nivel traduccional, aunque suele tener lugar al inicio de la transcripción.
Las bacterias, al igual que los organismos eucariotas, necesitan que algunos genes se expresen siempre, en las mismas condiciones. A estos genes se los denomina genes constitutivos o housekeeping genes. Generalmente se trata de enzimas del metabolismo básico celular. Sin embargo, existen otros genes que se expresan solo en determinadas condiciones. Son los llamados genes adaptativos. Las enzimas codificadas por dichos genes constituyen los sistemas enzimáticos adaptativos.
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La regulación de la expresión de los genes adaptativos se puede realizar mediante dos mecanismos: inducción y represión. A los sistemas cuya expresión aumenta por la presencia de un agente activador o inductor (generalmente, el sustrato de la enzima) se los denomina sistemas inducibles. Son sistemas que realizan procesos de degradación de un sustrato, como la lactosa (operón lac), arabinosa o maltosa.
Por el contrario, los sistemas a los que un agente correpresor (normalmente el producto final de la reacción) inhibe la expresión de las enzimas se los llaman sistemas represibles. Son sistemas de síntesis o anabolismo, como la síntesis de triptófano (operón trp) o histidina.
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En bacterias, los genes que codifican las enzimas de una vía metabólica se agrupan formando un operón. Así, todos los genes del operón se regulan de manera coordinada. Además, permite la transcripción coordinada de estos genes, lo que va a dar lugar a ARNm policistrónicos.
Un operón está formado por los siguientes elementos:
A continuación vamos a explicar dos ejemplos de operones, uno de un sistema inducible (operón lac) y otro de un sistema represible (operón Trp).
F. Jacob y J. Monod describieron la estructura y funcionamiento del operón lac de E. coli en 1960. Por estos descubrimientos recibieron el Premio Nobel de Fisiología o Medicina en 1965.
El operón lac está formado por el grupo de genes que regulan la producción de las enzimas encargadas de la degradación de la lactosa (disacárido formado por galactosa y glucosa). Está compuesto por:
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Aunque tradicionalmente se ha considerado que el inductor del operón lac es la lactosa, el verdadero inductor es la alolactosa, que se forma por glicosilación de la lactosa por actividad ocasional de la beta-galactosidasa. En los experimentos que utilizan el operón lac, se emplea como inductor IPTG (isopropil tiogalactósido), un análogo sintético de la lactosa, que no necesita a la permeasa para entrar en la bacteria.
En ausencia de lactosa en el medio, la proteína represora Lac I se une al operador, impidiendo la transcripción de los genes estructurales. Sin embargo, cuando hay lactosa en el medio, ésta se une al represor Lac I, cambia su conformación disminuyendo su afinidad por el operador. Así, el represor no es capaz de unirse al operador, lo que permite la transcripción de los genes estructurales. Se dice que el represor ejerce su influencia mediante control negativo.
El operón lac también puede ser regulado mediante control positivo por AMPc y por la proteína CAP o CRP. Cuando hay glucosa en el medio, las bacterias la emplean de manera preferente como fuente de energía y no metabolizan la lactosa. La concentración de glucosa está inver- samente relacionada con la concentración de AMPc de las células: a mayor concentración de glucosa, menor concentración de AMPc. Este AMPc se une a la proteína receptora de AMPc (CRP), también llamada proteína activadora de catabolitos (CAP). El complejo AMPc-CRP se une al promotor del operón lac, lo que provoca un cambio de conformación en el ADN que permite la unión de la RNA polimerasa y se inicie la transcripción. La presencia de AMPc-CRP es imprescindible para que tenga lugar la transcripción, aun cuando esté presente el inductor y el represor esté inactivo.
El operón Trp está formado por el grupo de genes que codifican los componentes necesarios para la producción triptófano. Está compuesto por:
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La proteína represora TrpR por sí sola no puede unirse al operador. Solamente cuando se une al triptófano, el complejo triptófano-TrpR puede interaccionar con el operador, impidiendo la unión de la RNA polimerasa y, por consiguiente, la transcripción de los genes estructurales. El triptófano actúa como correpresor.
Así, en ausencia de triptófano, el operador está libre, permitiendo la unión de la RNA polimerasa y la transcripción de los genes estructurales, lo que conduce a la traducción de las enzimas que participan en la síntesis de triptófano. Sin embargo, en presencia de triptófano, no se produce la transcripción.
El operón Trp también está regulado mediante otro mecanismo, el denominado regulación por atenuación. Este sistema controla el proceso de transcripción una vez comenzado. Se ha comprobado que cuando existen niveles bajos de triptófano, se transcribe todo el ARNm policistrónico y que, con niveles altos de triptófano, la mayor parte de los ARNm son de 140 bp. Es decir, los niveles altos de triptófano provocan una terminación temprana de la transcripción.
El mecanismo de regulación por atenuación está basado en la presencia de la región atenuadora en la secuencia líder TrpL.
Met-Lys-Ala-Ile-Phe-Val-Leu-Lys-Gly-Trp-Trp-Arg-Thr-Ser (STOP)
Esta secuencia puede formar horquillas autocomplementarias mutuamente excluyentes. Si se forman las horquillas 1-2 y 3-4, termina la transcripción. Si se forma la horquilla 2-3, la transcripción continúa. Cuando los niveles de triptófano son bajos, existen pocos ARNt-trp. Como en procariotas la transcripción y la traducción están acopladas, el ribosoma empieza a traducir el ARNm, pero se para sobre los codones que codifican Trp. Esto impide la formación de la horquilla 1-2. Cuando continúa la transcripción, se forma la horquilla 2-3, lo que da lugar a la transcripción y traducción de los ARNm completos. Cuando hay niveles altos de triptófano, se forman las horquillas 1-2 y 3-4, lo que provoca la terminación de la transcripción.
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